1688882.cn
環(huán)二鳥苷酸(c-di-GMP)是由鳥苷三磷酸在二鳥苷酸環(huán)化酶的作用下環(huán)化而形成的,這個反應的過程還需要有Mg2+作為輔助因子,以確保反應酶的活性。c-di-GMP作為細菌中的第二信使分子,參與調(diào)節(jié)多種生理功能,比如細胞分化,生物被膜形成,致病因子產(chǎn)生等。它的作用機制是通過二鳥苷環(huán)化酶(DGC)合成和磷酸二酯酶(PDE)的降解途徑進行調(diào)控的。c-di-GMP的化學式為C20H24N10O14P2,分子量為690.41。
檢測方法:高效液相色譜(HPLC)法,液相色譜質(zhì)譜聯(lián)用(LC-MS),酶聯(lián)免疫吸附(ELISA)法等。以HPLC為例,簡單的介紹一下檢測流程。
1.樣品處理
根據(jù)樣品中種類,如血清,血漿,細胞上清,組織勻漿等。采用不同的方法,去除雜質(zhì),超聲,離心,膜過濾,待測。具體操作過程和方法,需參考相關的標準、文獻或開發(fā)出來。
2.色譜條件
常規(guī)的C18反相色譜柱,250mmx4.6mm,5um,柱溫25℃;紫外檢測器,波長253nm;以乙酸銨和乙酸銨甲醇為流動相,梯度洗脫,流速0.8-1ml/min,進樣量10-20uL。僅供參考,需要重新驗證或調(diào)整參數(shù),獲得適合實際環(huán)境情況的最佳條件。
3.標準曲線
將c-di-GMP的標準品用水進行溶解和稀釋,配制成標準母液,記錄它的濃度值。然后,梯度稀釋5-7個點,可以成倍的進行,確保覆蓋到樣品溶液中的目標化合物可能濃度范圍。最低點一般是在定量限,以信噪比(S/N)的10倍確定。依次進樣到HPLC中,測出各個點的色譜峰,記錄它的保留時間。對各個峰的峰面積進行積分處理,并結(jié)合它的濃度,擬合出標準曲線,得到回歸方程。
4.含量計算
樣品溶液進樣到HPLC中,在軟件中記錄色譜峰。由于樣品是復雜的,沒有標品那么純正,因為可能會出現(xiàn)雜峰。根據(jù)標準色譜峰的保留時間,找到樣品中目標色譜峰的位置,并對它的峰面積進行手工或自動積分處理。將樣品的c-di-GMP的色譜峰面積代入到回歸方程,可計算出樣品溶液中的c-di-GMP的含量。